В общем, если подводных камней нет, то задача довольно банальна.
Достаточно любого ftp-клиента, если имеем дело с чистым гипертекстом.
Как я понимаю, локально сайт уже структурирован. Корневой директорией является та, в которой лежит главная (index.html or main.html or default.html)
Директория от корня льется по ftp на сервер в директорию, которую хостер обозначил как корень сайта (/var/www/user_name/site_name/ or /home/user_name/www/site_name/ or other)
Собственно, после этого сайт работает, если апач не говорит иного.