Обновил ppa для всех актуальных релизов Ubuntu:

ppa:vovansrnd/coolreader

Профиксил часть проблем старых сборок. И обновил сам CoolReader до версии 3.1.2-39.
Для корректной работы после первого запуска программы рекомендуется выполнить следующее:
wget http://dl.dropbox.com/u/22272434/src/cr3.ini -O/home/`whoami`/.cr3/cr3.ini
ln -s /usr/share/cr3/backgrounds/ /home/`whoami`/.cr3/backgrounds

Не знаю, почему вообще возникают с этим проблемы. Не программист. Но охотно бы принял патч для их решения, а так же для переопределения хоткеев на человеческие (скажем, F3 для открытия файла и F12 - для закрытия программы, это просто .... просто в голове не укладывается).

Почему до сих пор приходится использовать именно CoolReader - разбитие текста на две виртуальных страницы и текст сносок показывается на той же странице, где они указаны, а не в конце страницы.

Полный мой обзор с обновлёнными скриншотами